序一序二序三序四序五述古八则麻疯二十一论麻疯三十六种辨症图说五不治（轻亦可治）五主治内治九法外治六法疯门总论疯门总药正治诸方变治诸方攻下诸方外治诸方点痣法瘰烂法雷火针法千金方
秘传外科方
序序医家源流卷之上评脉（一）察视（二）五脏（三）汗吐下温水火刺灸八法（四）五脏虚实(五)五脏绝死（六）脉（七）周身经穴（八）伤寒（九）六经（十）时行疫疠（十一）湿（十二）寒热往来（十三）恶寒（十四）背
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
自序卷上石膏滑石芒硝甘草黄人参桔梗术白头翁卷中黄连黄芩柴胡贝母细辛当归芎芍药牡丹皮茵陈蒿艾麻黄地黄葶苈大黄大戟甘遂附子半夏芫花五味子栝蒌实葛根防己卷下香豉泽泻薏苡仁薤白干姜杏仁大枣橘皮吴茱萸瓜蒂桂枝浓
前言预防保健篇第一章 增进健康靠自己第一节 疲劳是万病之源第二节 一日保健术早晨醒来赖会儿床对镜观色刷牙、漱口冷水浴（脸）护肤晨饮一杯水适量运动梳头浴手搓面活动颈部缩唇呼气弯腰散步慢跑登高运动便后察病
《续编》序卷上赤石脂栝楼根蜀漆生姜卷下桃仁巴豆蜜虫虻虫阿胶粳米小麦大麦粉赤小豆胶饴酒醇酒清酒法醋苦酒美酒酰白酒浆水清浆水白饮饮暖水沸汤麻沸汤鸡子白鸡子黄鸡屎白马通汁猪膏猪脂猪肤猪胆獭肝羊胆羊肉蜘蛛蛴螬
题辞卷上脏腑经络先后病脉证第一湿病脉证第二百合狐惑阴阳毒病证治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证并治第五血痹虚劳病脉证并治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七奔豚气病脉证治第八胸痹心痛短气病脉证治第九腹满
石山医案
宣明方论